После успеха первого расследования Джуди Хоппс и Ник Уайлд официально становятся напарниками в полиции Зверополиса. Но их партнёрство ждёт серьёзная проверка: в городе разворачивается таинственный заговор, связанный с появлением рептилий — группы животных, о которых жители мегаполиса почти ничего не знают. По мере того как герои углубляются в дело, они сталкиваются с предрассудками, скрытыми сообществами и неожиданными союзниками. Параллельно Джуди и Ник посещают парную терапию, пытаясь разобраться в собственных отношениях — дружеских или, возможно, чуть больше. Сможет ли команда преодолеть внутренние и внешние препятствия, чтобы спасти Зверополис от новой угрозы?