Зрители следуют за новыми приключениями гениального суперзлодея Мегамозга, который столкнулся с серьёзной угрозой в лице Синдиката Рока — организации наиболее опасных преступников. После осознания, что угроза эта может разрушить не только его планы по завоеванию мира, но и сам мир, Мегамозг решается выступить в невероятном амплуа — защитника. Совместно со своим надежным помощником Минионом и неожиданным союзником, Мегамозг должен будет объединить свои усилия, чтобы предотвратить катастрофу.