Во втором сезоне команда московского Отдела по борьбе со сказочными преступлениями (ОБСП) переезжает в Санкт‑Петербург. Причина — новый след Кощея, который вселился в тело Василисы, племянницы главного героя Лёхи Попова. Теперь борьба с нечистью становится для Лёхи личным делом: он должен спасти девочку и вернуть ей прежний облик. В Петербурге героев ждёт череда загадочных событий. Всё начинается с убийства руководителя местного ОБСП и исчезновения других сотрудников петербургского отдела. В Северной столице происходит пробуждение древней тёмной силы, угрожающей всему миру. Главными подозреваемыми становится сам Кощей, а также полковник Воронов, способный превращаться в чёрного ворона. Этот злодей плетёт интриги, сеет смуту и становится ключевым фигурантом дела об убийстве петербургских оперативников. Полицейские сталкиваются с разнообразной нечистью, как исконно местной, так и завезённой ещё при Петре I.