После событий первой части Джуди и Ник продолжают работать в полиции. Однако на этот раз им предстоит не просто расследовать преступления, а разобраться в новой угрозе, которая грозит городу. В Зверополисе появляются загадочные исчезновения жителей, а слухи о тайной организации распространяются все быстрее. Наши герои отправляются в путешествие по разным районам мегаполиса, встречая новых персонажей, раскрывая заговор и снова доказывая, что дружба и справедливость важнее предрассудков.